新任命的首相图西族人阿尔班·尼亚莫尼亚由于在部族问题上的偏向态度,使布隆迪的部族冲突又起,影响到社会的安定。1965年1月11日,姆瓦姆布扎国王被迫撤回对尼亚莫尼亚内阁的信任,不得不再度任命胡图族恩根丹杜姆韦为首相,希望他能缓解部族矛盾和平息社会骚动。但当恩根丹杜姆韦1月15日去医院看望分娩的妻子和婴儿时,在医院门口被一群来自邻国卢旺达的图西族难民杀害,立即引起布隆迪政局的动荡。随后姆瓦姆布扎国王任命他的堂兄莱奥波特·比胡穆加尼为首相。10月,宪兵部队中的胡图族官兵发动叛乱,比胡穆加尼首相被打成重伤,后赴欧洲治疗。
王储篡位
姆瓦姆布扎国王吓得逃到欧洲,但却命令武装部队司令部进行镇压。宪兵部队的叛乱被镇压下去后,当局立即开始大规模逮捕反对派,从工会领导人到胡图族的著名人士不少人被处决。